Микробиота
Совокупность сообществ микроорганизмов (симбиотических, условно-патогенных и (или) патогенных), населяющих различные участки живых организмов с однородными условиями существования.
Федеральный закон от 30 декабря 2020 г. № 492-ФЗ “О биологической безопасности в Российской Федерации”
Адаптативный «орган», который выступает естественной биологической прослойкой между организмом человека (хозяина) и окружающей средой.
Метагеном
Совокупность генетического материала всех бактерий, населяющих какую-либо нишу организма.
Микробный экологический геном.
По метагеному можно охарактеризовать состав и баланс микрофлоры кишечника, сделать выводы о его вкладе в общее состояние здоровья человека, а также об эффекте, который на него оказывает прием того или иного лекарства или тип питания. Объем полезной информации, содержащийся в сотнях и тысячах метагеномов велик, и ее нельзя проанализировать вручную. Поэтому для интерпретации метагеномных данных нужны специальные инструменты.
https://news.itmo.ru/ru/science/life_science/news/8041/
Метагеномика
Раздел молекулярной генетики, в котором изучается генетический материал, полученный из образцов окружающей среды.
Метагеномика изучает набор генов всех микроорганизмов, находящихся в образце среды, — метагеном.
Метагеномный анализ позволяет определить видовое разнообразие исследуемого образца без необходимости выделения и культивирования микроорганизмов.
Микробиом
Микробиом человека — совокупность всех бактерий, населяющих какую-либо нишу организма. Он отвечает за многообразные реакции хозяина: от иммунного ответа на вторжение патогена до поведения и реакции на стресс. Микробиом человека, преимущественно, формируется в первые 3 года жизни. Самой многочисленной считается микробиота кишечника, на её долю приходится 60% всех микроорганизмов и более чем 1000 видов бактерий.
В организме человека живут 100 триллионов микробов. 95 % микробиоты находятся в желудочно-кишечном тракте. Гены микробиома превышают геном человека в 150 раз. Каждый микробиом человека уникален, как отпечатки пальцев. Считают, что 90% болезней могут быть связаны со "нездоровьем" кишечной экосистемы
ЖКТ взрослого человека содержит около 1800 родов и 15000-36000 видов бактерий, из которых доминирующими классами являются Bacteroidetes и Fermicutes: они составляют более 90% всех бактерий.Бактериальная метагеномика – совокупность всех геномов бактерий
Виром
Виром представляет собой совокупность всех вирусов, находящихся на слизистых оболочках, коже, во внутренних органах и системах человека
Вирусная метагеномика – совокупность всех геномов вирусов.
Миком
Совокупность всех грибов, населяющих какую-либо нишу организма.
Грибковая метагеномика – совокупность всех геномов грибов.
Дисбиоз
Изменение структуры и функционирования микробиоты. Возникает вследствие воздействия неблагоприятных факторов – стресс, режим питания, антибиотики, сигнализирует и сопровождает развитие основного заболевания (ЖКТ, метаболические расстройства, нейродегенеративные заболевания и пр.).
Ранее применялся термин "дисбактериоз", но из-за того, что в состав микробиоты входят не только бактерии, но дрожжеподобные грибы, а также вирусы, наиболее корректным считается термин "дисбиоз)
Правила забора материала
Смотрите инструкцию, которая идёт в комплекте пробирок